Effet de la prise d’antibiotiques sur le microbiote

Pour comprendre comment un antibiotique peut déséquilibrer le microbiote intestinal, on étudie par exemple les bactéries Lactobacillus et C. difficile. Ces deux bactéries sont en compétition pour le même nutriment, le tréhalose, et coexistent normalement en équilibre dans le microbiote.

Lorsqu’un individu prend un antibiotique, celui-ci tue aussi les bactéries utiles comme Lactobacillus, ce qui supprime cette compétition. Cela permet à certaines bactéries pathogènes, comme C. difficile, de se multiplier et de provoquer des diarrhées.